Od prvog slučaja korona virusa, u decembru 2019. godine, pandemijska bolest se proširila na milione ljudi širom svijeta.Ova globalna pandemija romanateški akutni respiratorni sindrom korona virus 2 (SARS-CoV-2)je jedna od najupečatljivijih i najzabrinjavajućih globalnih zdravstvenih kriza modernog doba, koja predstavlja veliku prijetnju svijetu i utječe na sve aspekte ljudskog života.[1]
Koronavirusi su jednolančani RNA virusi sa omotačem pozitivnog smisla iz porodice Coronaviridae, koji imaju širok spektar domaćina kao što su ljudi, slepi miševi, deve i ptičje vrste, uključujući stoku i kućne ljubimce, koji predstavljaju prijetnju javnom zdravlju. 1 Koronavirusi su klasifikovani u potporodicu Orthocoronavirinae, koja je dalje podijeljena u četiri roda, na osnovu razlika u proteinskim sekvencama: a-koronavirus, b-koronavirus, g-koronavirus i d-koronavirus.A-koronavirusi i b-koronavirusi inficiraju samo sisare, dok g-koronavirusi i d-koronavirusi prvenstveno inficiraju ptice, iako neki od njih mogu zaraziti sisare.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV i SARS-CoV-2 sedam su koronavirusa za koje je utvrđeno da inficiraju ljude.Među njima su SARSCoV i MERS-CoV, koji su se pojavili u ljudskoj populaciji 2002. i 2012. godine, visoko patogeni.Dok sojevi humanog koronavirusa (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 ili HCoV-HKU1 koji cirkuliraju u ljudskoj populaciji uzrokuju samo običnu prehladu,7 teški akutni respiratorni sindrom koronavirus 2 (SARS-CoV2), uzročnik COVID-19, je novi b-korona virus, koji se rano pojavio krajem 2019. godine i rezultirao je razornim smrtnim slučajevima.Primarni simptomi odCOVID 19slični su onima kod SARS-CoV i MERS-CoV: groznica, umor, suhi kašalj, bol u gornjem dijelu grudi, ponekad dijareja i dispneja.Za razliku od prošlostiinfekcije koronavirusom (CoV)., brza globalna diseminacija, visoka stopa prijenosa, duže vrijeme inkubacije, više asimptomatskih infekcija i ozbiljnost bolesti SARS-CoV-2 zahtijevaju dubinsko znanje u vezi sa strategijama virusne imunološke evazije.
Kao i drugi ljudski korona virusi (SARS-CoV-2, MERS-CoV), SARSCoV-2 također ima jednolančani RNA genom pozitivnog smisla veličine oko 30 kb.Kao što je prikazano na slici 1, proteini virusnog nukleokapsida (N) povezuju genom u veliki kompleks ribonukleoproteina (RNP), koji je zatim obavijen lipidima i virusnim proteinima S (šiljak), M (membrana) i E (omotač).Kraj 50 genoma ima dva velika otvorena okvira za čitanje (ORF), ORF1a i ORF1b, koji kodiraju polipeptide pp1a i pp1b, koji se proizvode u 16 nestrukturnih proteina (NSP) koji uključuju svaki aspekt virusne replikacije pomoću virusnih proteaza NSP3 i NSP5 koje sadrže domen proteaze slična papainu i domen proteaze slična 3C, respektivno.9 30 kraj genoma kodira strukturne proteine i pomoćne proteine, za koje je dokazano da su ORF3a, ORF6, ORF7a i ORF7b uključeni u strukturne proteine virusa u formiranju virusnih čestica i ORF3b i ORF6 funkcionišu kao antagonisti interferona.Prema trenutnoj napomeni na osnovu sličnosti sekvence sa drugim b-korona virusima, SARS-CoV-2 uključuje predviđanja šest pomoćnih proteina (3a, 6, 7a, 7b, 8 i 10).Međutim, svi ovi ORF-ovi još uvijek nisu eksperimentalno potvrđeni, a tačan broj pomoćnih gena SARS-CoV-2 još uvijek je predmet spora.Stoga je još uvijek nejasno koji su dodatni geni zapravo eksprimirani ovim kompaktnim genomom.[2]
Visoko osjetljivi i specifični testovi ključni su za identifikaciju i upravljanje pacijentima s COVID-19, kao i za provođenje kontrolnih mjera za ograničavanje izbijanja.Molekularni testovi na mjestu zbrinjavanja (POC) imaju potencijal da omoguće ranije otkrivanje i2 izolaciju potvrđenih slučajeva SARS-CoV-2, u poređenju s laboratorijskim dijagnostičkim metodama, čime se smanjuje prijenos u domaćinstvu i zajednici.
[1]Klinički i operativni utjecaj brzog otkrivanja SARS-CoV-2 na mjestu pružanja pomoći u odjelu hitne pomoći
[2] Bitka između domaćina i SARS-CoV-2: Urođeni imunitet i strategije izbjegavanja virusa
Vrijeme objave: 25.05.2022